芹菜茎基部腐烂，闻起来有臭味，应是细菌性软腐病，主要是茎基部长期处于郁闭遮荫状态，湿度大，在生长过程中茎基部一旦有伤口，就会感染细菌造成侵染腐烂。因为芹菜亩株数多，茎基部灌根难度大，可随水冲施铜制剂，或者叶面喷施细菌性药剂，同时，管理中注意降低棚内湿度。